液相色譜的柱子通常分為正相柱和反相柱。正相柱大多以硅膠為柱，或是在硅膠表面鍵合-CN,-NH3等官能團的鍵合相硅膠柱；反相柱填料主要以硅膠為基質，在其表面鍵合非極性的十八烷基官能團（ODS）稱為C18柱，其它常用的反相柱還有C8,C4,C2和苯基柱等。
C18色譜柱的使用：
1、 新柱子在使用前需用純有機試劑（如甲醇、乙腈）低流速沖洗，沖洗體積以20倍柱體積為宜，以便固定相能充分潤濕、碳鏈能舒展*，使色譜柱的性能達到狀態；
2、 使用時需在每日實驗結束后沖洗色譜柱，尤其是流動相中含有酸或鹽時，需將色譜柱中的酸或鹽沖洗干凈，通常建議用10%甲醇水沖洗20倍柱體積；
3、 長期保存前要將色譜柱*沖洗，建議沖洗3-4小時以上，后保存在純有機試劑或高比例的有機試劑溶液（如90%甲醇水）中；
4、 日常保存溶劑（即第二天需繼續使用時）盡量與3中相同；
5、 由于C18柱（極性改性處理的除外）的固定相疏水性較強，在使用過程中盡量不要使用高水相條件，若水相比例過高，易引起固定相疏水塌陷，導致柱效迅速下降，甚至造成不可逆的負面影響，建議使用過程中水相比例不超過90%；
6、 色譜柱壓力升高、柱性能下降：通常為色譜柱被污染，對色譜柱進行再生處理可恢復部分柱效；
7、 色譜柱壓力驟升，通常由鹽析出或篩板堵塞引起。若是鹽析出，用10%甲醇水低流速沖洗至壓力恢復即可；若判斷并非鹽析出，以純甲醇或10%甲醇水為流動相反沖色譜柱（將色譜柱反接，不接檢測器），若反沖半小時仍無效果，則需尋找其他原因。
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